Microbiote du sol, des plantes, animal et humain : qu'ont-ils à nous apprendre ?

Infographie – Sol, plante, animal et homme : quand les micro-organismes interagissent ensemble

Tout être-vivant – sol, plante, animal et humain – comporte un microbiote renfermant différents micro-organismes plus ou moins identiques, avec une diversité et des acteurs dominants qui varient d’un hôte à l’autre. Depuis plusieurs années, un nombre croissant d’études suggère que ces différentes communautés microbiennes sont interconnectées et forment une « boucle microbienne » tirant son origine du sol.

Aujourd’hui considéré comme le plus diversifié et le plus complexe de la planète, le microbiome (voir encadré) du sol est une source importante de micro-organismes pour les écosystèmes. Le microbiome du sol correspond à l’ensemble des génomes des communautés de micro-organismes vivant sous terre et tient compte des interactions microbiennes et des conditions environnementales qui les entourent. Il s’agit notamment du plus grand contributeur au microbiote des plantes. Au travers d’interactions directes – exposition au sol, poussières – ou indirectes – consommation de viande et/ou de végétaux, géophagie – les micro-organismes du sol peuvent également se retrouver dans le microbiote intestinal animal et humain.

Micro-organismes, microbiote et microbiome : quelles différences ?
  • Les micro-organismes sont des êtres vivants microscopiques tels que les bactéries, les virus, les champignons unicellulaires et les protistes.
  • Le microbiote correspond à une communauté de micro-organismes vivant dans un environnement spécifique.
  • Le microbiome est quant à lui l’ensemble des génomes des microbiotes qui tient compte des interactions entre les micro-organismes et les conditions environnementales qui les entourent.
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